Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG08

HELB, DNA helicase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELBQ8NG08 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HELBQ8NG08 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HELBQ8NG08 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
HELBQ8NG08 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HELBQ8NG08 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HELBQ8NG08 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HELBQ8NG08 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
HELBQ8NG08 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HELBQ8NG08 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HELBQ8NG08 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HELBQ8NG08 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HELBQ8NG08 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
HELBQ8NG08 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HELBQ8NG08 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HELBQ8NG08 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HELBQ8NG08 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HELBQ8NG08 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HELBQ8NG08 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HELBQ8NG08 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HELBQ8NG08 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
HELBQ8NG08 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
HELBQ8NG08 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HELBQ8NG08 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HELBQ8NG08 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HELBQ8NG08 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HELBQ8NG08 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HELBQ8NG08 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HELBQ8NG08 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HELBQ8NG08 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HELBQ8NG08 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HELBQ8NG08 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HELBQ8NG08 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HELBQ8NG08 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HELBQ8NG08 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HELBQ8NG08 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HELBQ8NG08 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HELBQ8NG08 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HELBQ8NG08 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HELBQ8NG08 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HELBQ8NG08 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HELBQ8NG08 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HELBQ8NG08 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HELBQ8NG08 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HELBQ8NG08 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HELBQ8NG08 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HELBQ8NG08 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HELBQ8NG08 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HELBQ8NG08 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HELBQ8NG08 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HELBQ8NG08 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HELBQ8NG08 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
HELBQ8NG08 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HELBQ8NG08 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HELBQ8NG08 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HELBQ8NG08 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HELBQ8NG08 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HELBQ8NG08 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HELBQ8NG08 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HELBQ8NG08 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HELBQ8NG08 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HELBQ8NG08 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HELBQ8NG08 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HELBQ8NG08 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HELBQ8NG08 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HELBQ8NG08 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HELBQ8NG08 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HELBQ8NG08 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HELBQ8NG08 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HELBQ8NG08 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HELBQ8NG08 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
HELBQ8NG08 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HELBQ8NG08 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HELBQ8NG08 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HELBQ8NG08 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HELBQ8NG08 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HELBQ8NG08 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HELBQ8NG08 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HELBQ8NG08 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
HELBQ8NG08 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HELBQ8NG08 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HELBQ8NG08 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
HELBQ8NG08 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HELBQ8NG08 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HELBQ8NG08 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HELBQ8NG08 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
HELBQ8NG08 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HELBQ8NG08 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HELBQ8NG08 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HELBQ8NG08 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HELBQ8NG08 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HELBQ8NG08 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HELBQ8NG08 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HELBQ8NG08 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HELBQ8NG08 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HELBQ8NG08 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HELBQ8NG08 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HELBQ8NG08 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HELBQ8NG08 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HELBQ8NG08 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HELBQ8NG08 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms