Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR7

CCDC148, Coiled-coil domain-containing protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC148Q8NFR7 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC148Q8NFR7 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC148Q8NFR7 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms