Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFJ8

BHLHE22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE22Q8NFJ8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHLHE22Q8NFJ8 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHLHE22Q8NFJ8 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHLHE22Q8NFJ8 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHLHE22Q8NFJ8 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHLHE22Q8NFJ8 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHLHE22Q8NFJ8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHLHE22Q8NFJ8 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHLHE22Q8NFJ8 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHLHE22Q8NFJ8 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHLHE22Q8NFJ8 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
BHLHE22Q8NFJ8 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHLHE22Q8NFJ8 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHLHE22Q8NFJ8 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHLHE22Q8NFJ8 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHLHE22Q8NFJ8 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHLHE22Q8NFJ8 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHLHE22Q8NFJ8 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHLHE22Q8NFJ8 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHLHE22Q8NFJ8 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHLHE22Q8NFJ8 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHLHE22Q8NFJ8 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHLHE22Q8NFJ8 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHLHE22Q8NFJ8 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
BHLHE22Q8NFJ8 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHLHE22Q8NFJ8 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHLHE22Q8NFJ8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
BHLHE22Q8NFJ8 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
BHLHE22Q8NFJ8 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHLHE22Q8NFJ8 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHLHE22Q8NFJ8 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHLHE22Q8NFJ8 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
BHLHE22Q8NFJ8 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHLHE22Q8NFJ8 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHLHE22Q8NFJ8 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHLHE22Q8NFJ8 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHLHE22Q8NFJ8 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHLHE22Q8NFJ8 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHLHE22Q8NFJ8 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHLHE22Q8NFJ8 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHLHE22Q8NFJ8 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHLHE22Q8NFJ8 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHLHE22Q8NFJ8 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHLHE22Q8NFJ8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHLHE22Q8NFJ8 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
BHLHE22Q8NFJ8 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHLHE22Q8NFJ8 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHLHE22Q8NFJ8 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHLHE22Q8NFJ8 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHLHE22Q8NFJ8 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHLHE22Q8NFJ8 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHLHE22Q8NFJ8 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHLHE22Q8NFJ8 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHLHE22Q8NFJ8 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHLHE22Q8NFJ8 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHLHE22Q8NFJ8 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHLHE22Q8NFJ8 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHLHE22Q8NFJ8 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHLHE22Q8NFJ8 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHLHE22Q8NFJ8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHLHE22Q8NFJ8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHLHE22Q8NFJ8 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHLHE22Q8NFJ8 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHLHE22Q8NFJ8 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHLHE22Q8NFJ8 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHLHE22Q8NFJ8 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHLHE22Q8NFJ8 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHLHE22Q8NFJ8 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHLHE22Q8NFJ8 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHLHE22Q8NFJ8 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHLHE22Q8NFJ8 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHLHE22Q8NFJ8 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHLHE22Q8NFJ8 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHLHE22Q8NFJ8 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHLHE22Q8NFJ8 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHLHE22Q8NFJ8 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHLHE22Q8NFJ8 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHLHE22Q8NFJ8 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHLHE22Q8NFJ8 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHLHE22Q8NFJ8 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHLHE22Q8NFJ8 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHLHE22Q8NFJ8 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHLHE22Q8NFJ8 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHLHE22Q8NFJ8 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHLHE22Q8NFJ8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
BHLHE22Q8NFJ8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHLHE22Q8NFJ8 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHLHE22Q8NFJ8 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHLHE22Q8NFJ8 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHLHE22Q8NFJ8 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHLHE22Q8NFJ8 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHLHE22Q8NFJ8 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHLHE22Q8NFJ8 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHLHE22Q8NFJ8 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BHLHE22Q8NFJ8 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BHLHE22Q8NFJ8 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
BHLHE22Q8NFJ8 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BHLHE22Q8NFJ8 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BHLHE22Q8NFJ8 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BHLHE22Q8NFJ8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms