Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP7

KLHDC9, Kelch domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC9Q8NEP7 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHDC9Q8NEP7 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHDC9Q8NEP7 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHDC9Q8NEP7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHDC9Q8NEP7 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHDC9Q8NEP7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHDC9Q8NEP7 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHDC9Q8NEP7 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHDC9Q8NEP7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHDC9Q8NEP7 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHDC9Q8NEP7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHDC9Q8NEP7 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHDC9Q8NEP7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHDC9Q8NEP7 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHDC9Q8NEP7 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHDC9Q8NEP7 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHDC9Q8NEP7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHDC9Q8NEP7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHDC9Q8NEP7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHDC9Q8NEP7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHDC9Q8NEP7 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHDC9Q8NEP7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHDC9Q8NEP7 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHDC9Q8NEP7 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHDC9Q8NEP7 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHDC9Q8NEP7 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHDC9Q8NEP7 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHDC9Q8NEP7 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHDC9Q8NEP7 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHDC9Q8NEP7 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHDC9Q8NEP7 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHDC9Q8NEP7 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHDC9Q8NEP7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHDC9Q8NEP7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHDC9Q8NEP7 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHDC9Q8NEP7 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHDC9Q8NEP7 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHDC9Q8NEP7 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHDC9Q8NEP7 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHDC9Q8NEP7 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHDC9Q8NEP7 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHDC9Q8NEP7 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHDC9Q8NEP7 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHDC9Q8NEP7 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHDC9Q8NEP7 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHDC9Q8NEP7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHDC9Q8NEP7 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHDC9Q8NEP7 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHDC9Q8NEP7 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHDC9Q8NEP7 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHDC9Q8NEP7 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHDC9Q8NEP7 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHDC9Q8NEP7 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHDC9Q8NEP7 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHDC9Q8NEP7 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHDC9Q8NEP7 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHDC9Q8NEP7 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHDC9Q8NEP7 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHDC9Q8NEP7 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHDC9Q8NEP7 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHDC9Q8NEP7 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KLHDC9Q8NEP7 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KLHDC9Q8NEP7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHDC9Q8NEP7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms