Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP4

C17orf47, Uncharacterized protein C17orf47, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf47Q8NEP4 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C17orf47Q8NEP4 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
C17orf47Q8NEP4 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
C17orf47Q8NEP4 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
C17orf47Q8NEP4 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
C17orf47Q8NEP4 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
C17orf47Q8NEP4 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C17orf47Q8NEP4 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C17orf47Q8NEP4 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C17orf47Q8NEP4 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C17orf47Q8NEP4 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C17orf47Q8NEP4 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C17orf47Q8NEP4 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C17orf47Q8NEP4 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C17orf47Q8NEP4 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C17orf47Q8NEP4 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C17orf47Q8NEP4 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
C17orf47Q8NEP4 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C17orf47Q8NEP4 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C17orf47Q8NEP4 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C17orf47Q8NEP4 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C17orf47Q8NEP4 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C17orf47Q8NEP4 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C17orf47Q8NEP4 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C17orf47Q8NEP4 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C17orf47Q8NEP4 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C17orf47Q8NEP4 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C17orf47Q8NEP4 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C17orf47Q8NEP4 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C17orf47Q8NEP4 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C17orf47Q8NEP4 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C17orf47Q8NEP4 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C17orf47Q8NEP4 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C17orf47Q8NEP4 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C17orf47Q8NEP4 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C17orf47Q8NEP4 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C17orf47Q8NEP4 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C17orf47Q8NEP4 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C17orf47Q8NEP4 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C17orf47Q8NEP4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C17orf47Q8NEP4 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C17orf47Q8NEP4 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C17orf47Q8NEP4 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C17orf47Q8NEP4 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C17orf47Q8NEP4 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C17orf47Q8NEP4 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C17orf47Q8NEP4 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms