Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC112Q8NEF3 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms