Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA66

CNBD1, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD1Q8NA66 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNBD1Q8NA66 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNBD1Q8NA66 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CNBD1Q8NA66 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNBD1Q8NA66 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CNBD1Q8NA66 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CNBD1Q8NA66 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNBD1Q8NA66 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNBD1Q8NA66 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNBD1Q8NA66 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNBD1Q8NA66 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNBD1Q8NA66 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNBD1Q8NA66 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CNBD1Q8NA66 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNBD1Q8NA66 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNBD1Q8NA66 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNBD1Q8NA66 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNBD1Q8NA66 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNBD1Q8NA66 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNBD1Q8NA66 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNBD1Q8NA66 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNBD1Q8NA66 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNBD1Q8NA66 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNBD1Q8NA66 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms