Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA03

FSIP1, Fibrous sheath-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSIP1Q8NA03 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FSIP1Q8NA03 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FSIP1Q8NA03 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FSIP1Q8NA03 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FSIP1Q8NA03 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FSIP1Q8NA03 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FSIP1Q8NA03 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FSIP1Q8NA03 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FSIP1Q8NA03 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FSIP1Q8NA03 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FSIP1Q8NA03 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FSIP1Q8NA03 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FSIP1Q8NA03 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FSIP1Q8NA03 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FSIP1Q8NA03 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FSIP1Q8NA03 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FSIP1Q8NA03 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FSIP1Q8NA03 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FSIP1Q8NA03 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FSIP1Q8NA03 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FSIP1Q8NA03 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FSIP1Q8NA03 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FSIP1Q8NA03 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FSIP1Q8NA03 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FSIP1Q8NA03 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FSIP1Q8NA03 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FSIP1Q8NA03 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FSIP1Q8NA03 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FSIP1Q8NA03 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FSIP1Q8NA03 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FSIP1Q8NA03 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FSIP1Q8NA03 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FSIP1Q8NA03 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FSIP1Q8NA03 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FSIP1Q8NA03 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FSIP1Q8NA03 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FSIP1Q8NA03 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FSIP1Q8NA03 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FSIP1Q8NA03 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FSIP1Q8NA03 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FSIP1Q8NA03 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FSIP1Q8NA03 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FSIP1Q8NA03 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FSIP1Q8NA03 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FSIP1Q8NA03 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FSIP1Q8NA03 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FSIP1Q8NA03 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FSIP1Q8NA03 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FSIP1Q8NA03 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FSIP1Q8NA03 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FSIP1Q8NA03 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
FSIP1Q8NA03 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FSIP1Q8NA03 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms