Protein–RNA interactions for Protein: Q8N239

KLHL34, Kelch-like protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL34Q8N239 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
KLHL34Q8N239 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KLHL34Q8N239 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KLHL34Q8N239 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KLHL34Q8N239 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KLHL34Q8N239 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
KLHL34Q8N239 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KLHL34Q8N239 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KLHL34Q8N239 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KLHL34Q8N239 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KLHL34Q8N239 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KLHL34Q8N239 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
KLHL34Q8N239 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KLHL34Q8N239 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KLHL34Q8N239 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KLHL34Q8N239 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KLHL34Q8N239 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KLHL34Q8N239 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KLHL34Q8N239 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KLHL34Q8N239 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KLHL34Q8N239 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KLHL34Q8N239 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KLHL34Q8N239 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KLHL34Q8N239 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KLHL34Q8N239 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KLHL34Q8N239 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KLHL34Q8N239 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KLHL34Q8N239 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
KLHL34Q8N239 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KLHL34Q8N239 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KLHL34Q8N239 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KLHL34Q8N239 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KLHL34Q8N239 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
KLHL34Q8N239 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
KLHL34Q8N239 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KLHL34Q8N239 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KLHL34Q8N239 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
KLHL34Q8N239 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
KLHL34Q8N239 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KLHL34Q8N239 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KLHL34Q8N239 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KLHL34Q8N239 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KLHL34Q8N239 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KLHL34Q8N239 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
KLHL34Q8N239 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KLHL34Q8N239 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KLHL34Q8N239 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
KLHL34Q8N239 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KLHL34Q8N239 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KLHL34Q8N239 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KLHL34Q8N239 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KLHL34Q8N239 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KLHL34Q8N239 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KLHL34Q8N239 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHL34Q8N239 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHL34Q8N239 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHL34Q8N239 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHL34Q8N239 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHL34Q8N239 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHL34Q8N239 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHL34Q8N239 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHL34Q8N239 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHL34Q8N239 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHL34Q8N239 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHL34Q8N239 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHL34Q8N239 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHL34Q8N239 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHL34Q8N239 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHL34Q8N239 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHL34Q8N239 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHL34Q8N239 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHL34Q8N239 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHL34Q8N239 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHL34Q8N239 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHL34Q8N239 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHL34Q8N239 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLHL34Q8N239 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLHL34Q8N239 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLHL34Q8N239 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLHL34Q8N239 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLHL34Q8N239 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
KLHL34Q8N239 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLHL34Q8N239 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLHL34Q8N239 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLHL34Q8N239 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLHL34Q8N239 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLHL34Q8N239 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLHL34Q8N239 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLHL34Q8N239 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLHL34Q8N239 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLHL34Q8N239 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLHL34Q8N239 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLHL34Q8N239 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLHL34Q8N239 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLHL34Q8N239 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLHL34Q8N239 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLHL34Q8N239 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLHL34Q8N239 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KLHL34Q8N239 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KLHL34Q8N239 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms