Protein–RNA interactions for Protein: Q8N158

GPC2, Glypican-2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC2Q8N158 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPC2Q8N158 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GPC2Q8N158 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GPC2Q8N158 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPC2Q8N158 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPC2Q8N158 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPC2Q8N158 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPC2Q8N158 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPC2Q8N158 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPC2Q8N158 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPC2Q8N158 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPC2Q8N158 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPC2Q8N158 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPC2Q8N158 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPC2Q8N158 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPC2Q8N158 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPC2Q8N158 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPC2Q8N158 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPC2Q8N158 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPC2Q8N158 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GPC2Q8N158 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPC2Q8N158 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPC2Q8N158 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GPC2Q8N158 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPC2Q8N158 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPC2Q8N158 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPC2Q8N158 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPC2Q8N158 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPC2Q8N158 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPC2Q8N158 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPC2Q8N158 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPC2Q8N158 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPC2Q8N158 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPC2Q8N158 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPC2Q8N158 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
GPC2Q8N158 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPC2Q8N158 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPC2Q8N158 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPC2Q8N158 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
GPC2Q8N158 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPC2Q8N158 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPC2Q8N158 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPC2Q8N158 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
GPC2Q8N158 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
GPC2Q8N158 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPC2Q8N158 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPC2Q8N158 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPC2Q8N158 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPC2Q8N158 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPC2Q8N158 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPC2Q8N158 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPC2Q8N158 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPC2Q8N158 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPC2Q8N158 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPC2Q8N158 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GPC2Q8N158 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GPC2Q8N158 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GPC2Q8N158 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPC2Q8N158 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GPC2Q8N158 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GPC2Q8N158 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPC2Q8N158 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPC2Q8N158 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPC2Q8N158 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPC2Q8N158 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GPC2Q8N158 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPC2Q8N158 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPC2Q8N158 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPC2Q8N158 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
GPC2Q8N158 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPC2Q8N158 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPC2Q8N158 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPC2Q8N158 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPC2Q8N158 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPC2Q8N158 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPC2Q8N158 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPC2Q8N158 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPC2Q8N158 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPC2Q8N158 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPC2Q8N158 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPC2Q8N158 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPC2Q8N158 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPC2Q8N158 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPC2Q8N158 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GPC2Q8N158 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPC2Q8N158 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPC2Q8N158 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPC2Q8N158 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPC2Q8N158 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPC2Q8N158 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPC2Q8N158 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPC2Q8N158 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
GPC2Q8N158 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPC2Q8N158 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPC2Q8N158 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPC2Q8N158 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPC2Q8N158 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPC2Q8N158 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPC2Q8N158 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPC2Q8N158 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms