Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
LMNTD2Q8IXW0 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms