Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLF2Q8IX21 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLF2Q8IX21 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLF2Q8IX21 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLF2Q8IX21 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLF2Q8IX21 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLF2Q8IX21 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLF2Q8IX21 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLF2Q8IX21 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLF2Q8IX21 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLF2Q8IX21 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLF2Q8IX21 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SLF2Q8IX21 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLF2Q8IX21 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLF2Q8IX21 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLF2Q8IX21 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLF2Q8IX21 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLF2Q8IX21 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLF2Q8IX21 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLF2Q8IX21 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLF2Q8IX21 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLF2Q8IX21 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLF2Q8IX21 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLF2Q8IX21 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLF2Q8IX21 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLF2Q8IX21 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLF2Q8IX21 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLF2Q8IX21 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SLF2Q8IX21 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLF2Q8IX21 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLF2Q8IX21 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLF2Q8IX21 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLF2Q8IX21 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLF2Q8IX21 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLF2Q8IX21 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLF2Q8IX21 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLF2Q8IX21 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLF2Q8IX21 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLF2Q8IX21 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLF2Q8IX21 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLF2Q8IX21 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLF2Q8IX21 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLF2Q8IX21 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLF2Q8IX21 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLF2Q8IX21 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLF2Q8IX21 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLF2Q8IX21 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLF2Q8IX21 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLF2Q8IX21 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLF2Q8IX21 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLF2Q8IX21 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLF2Q8IX21 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLF2Q8IX21 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLF2Q8IX21 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLF2Q8IX21 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLF2Q8IX21 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLF2Q8IX21 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SLF2Q8IX21 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SLF2Q8IX21 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLF2Q8IX21 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SLF2Q8IX21 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLF2Q8IX21 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLF2Q8IX21 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLF2Q8IX21 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLF2Q8IX21 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLF2Q8IX21 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLF2Q8IX21 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLF2Q8IX21 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLF2Q8IX21 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLF2Q8IX21 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLF2Q8IX21 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLF2Q8IX21 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms