Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SKAP1Q86WV1 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SKAP1Q86WV1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SKAP1Q86WV1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SKAP1Q86WV1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SKAP1Q86WV1 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SKAP1Q86WV1 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SKAP1Q86WV1 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SKAP1Q86WV1 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SKAP1Q86WV1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SKAP1Q86WV1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SKAP1Q86WV1 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SKAP1Q86WV1 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SKAP1Q86WV1 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SKAP1Q86WV1 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SKAP1Q86WV1 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SKAP1Q86WV1 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SKAP1Q86WV1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SKAP1Q86WV1 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SKAP1Q86WV1 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SKAP1Q86WV1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SKAP1Q86WV1 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SKAP1Q86WV1 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SKAP1Q86WV1 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SKAP1Q86WV1 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SKAP1Q86WV1 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SKAP1Q86WV1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SKAP1Q86WV1 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SKAP1Q86WV1 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SKAP1Q86WV1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SKAP1Q86WV1 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SKAP1Q86WV1 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SKAP1Q86WV1 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SKAP1Q86WV1 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SKAP1Q86WV1 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SKAP1Q86WV1 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SKAP1Q86WV1 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SKAP1Q86WV1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SKAP1Q86WV1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SKAP1Q86WV1 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SKAP1Q86WV1 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SKAP1Q86WV1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SKAP1Q86WV1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SKAP1Q86WV1 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SKAP1Q86WV1 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SKAP1Q86WV1 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SKAP1Q86WV1 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SKAP1Q86WV1 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SKAP1Q86WV1 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SKAP1Q86WV1 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SKAP1Q86WV1 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SKAP1Q86WV1 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SKAP1Q86WV1 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SKAP1Q86WV1 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SKAP1Q86WV1 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SKAP1Q86WV1 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SKAP1Q86WV1 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SKAP1Q86WV1 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SKAP1Q86WV1 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SKAP1Q86WV1 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SKAP1Q86WV1 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SKAP1Q86WV1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SKAP1Q86WV1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SKAP1Q86WV1 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SKAP1Q86WV1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SKAP1Q86WV1 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SKAP1Q86WV1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SKAP1Q86WV1 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SKAP1Q86WV1 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SKAP1Q86WV1 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SKAP1Q86WV1 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SKAP1Q86WV1 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SKAP1Q86WV1 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SKAP1Q86WV1 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SKAP1Q86WV1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SKAP1Q86WV1 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SKAP1Q86WV1 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SKAP1Q86WV1 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SKAP1Q86WV1 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SKAP1Q86WV1 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SKAP1Q86WV1 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SKAP1Q86WV1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SKAP1Q86WV1 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SKAP1Q86WV1 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SKAP1Q86WV1 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SKAP1Q86WV1 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SKAP1Q86WV1 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SKAP1Q86WV1 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SKAP1Q86WV1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SKAP1Q86WV1 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SKAP1Q86WV1 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SKAP1Q86WV1 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
SKAP1Q86WV1 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SKAP1Q86WV1 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SKAP1Q86WV1 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SKAP1Q86WV1 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SKAP1Q86WV1 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SKAP1Q86WV1 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SKAP1Q86WV1 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SKAP1Q86WV1 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms