Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7A3

CTU1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU1Q7Z7A3 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CTU1Q7Z7A3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CTU1Q7Z7A3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CTU1Q7Z7A3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CTU1Q7Z7A3 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTU1Q7Z7A3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CTU1Q7Z7A3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CTU1Q7Z7A3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTU1Q7Z7A3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTU1Q7Z7A3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTU1Q7Z7A3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTU1Q7Z7A3 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTU1Q7Z7A3 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTU1Q7Z7A3 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTU1Q7Z7A3 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CTU1Q7Z7A3 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTU1Q7Z7A3 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTU1Q7Z7A3 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CTU1Q7Z7A3 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CTU1Q7Z7A3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTU1Q7Z7A3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTU1Q7Z7A3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTU1Q7Z7A3 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTU1Q7Z7A3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTU1Q7Z7A3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTU1Q7Z7A3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTU1Q7Z7A3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTU1Q7Z7A3 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTU1Q7Z7A3 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTU1Q7Z7A3 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTU1Q7Z7A3 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTU1Q7Z7A3 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTU1Q7Z7A3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTU1Q7Z7A3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTU1Q7Z7A3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTU1Q7Z7A3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTU1Q7Z7A3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTU1Q7Z7A3 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CTU1Q7Z7A3 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTU1Q7Z7A3 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTU1Q7Z7A3 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTU1Q7Z7A3 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTU1Q7Z7A3 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTU1Q7Z7A3 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTU1Q7Z7A3 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTU1Q7Z7A3 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTU1Q7Z7A3 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CTU1Q7Z7A3 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CTU1Q7Z7A3 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CTU1Q7Z7A3 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CTU1Q7Z7A3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTU1Q7Z7A3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTU1Q7Z7A3 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTU1Q7Z7A3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTU1Q7Z7A3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTU1Q7Z7A3 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTU1Q7Z7A3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTU1Q7Z7A3 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTU1Q7Z7A3 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTU1Q7Z7A3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTU1Q7Z7A3 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CTU1Q7Z7A3 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTU1Q7Z7A3 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTU1Q7Z7A3 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTU1Q7Z7A3 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTU1Q7Z7A3 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTU1Q7Z7A3 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTU1Q7Z7A3 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTU1Q7Z7A3 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTU1Q7Z7A3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTU1Q7Z7A3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTU1Q7Z7A3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTU1Q7Z7A3 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTU1Q7Z7A3 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTU1Q7Z7A3 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTU1Q7Z7A3 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTU1Q7Z7A3 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTU1Q7Z7A3 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTU1Q7Z7A3 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTU1Q7Z7A3 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CTU1Q7Z7A3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTU1Q7Z7A3 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTU1Q7Z7A3 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTU1Q7Z7A3 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTU1Q7Z7A3 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTU1Q7Z7A3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTU1Q7Z7A3 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTU1Q7Z7A3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTU1Q7Z7A3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTU1Q7Z7A3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTU1Q7Z7A3 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTU1Q7Z7A3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTU1Q7Z7A3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTU1Q7Z7A3 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms