Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3C6

ATG9A, Autophagy-related protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9AQ7Z3C6 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATG9AQ7Z3C6 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATG9AQ7Z3C6 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATG9AQ7Z3C6 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATG9AQ7Z3C6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATG9AQ7Z3C6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATG9AQ7Z3C6 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATG9AQ7Z3C6 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATG9AQ7Z3C6 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATG9AQ7Z3C6 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATG9AQ7Z3C6 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATG9AQ7Z3C6 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATG9AQ7Z3C6 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATG9AQ7Z3C6 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATG9AQ7Z3C6 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATG9AQ7Z3C6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATG9AQ7Z3C6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATG9AQ7Z3C6 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ATG9AQ7Z3C6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATG9AQ7Z3C6 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATG9AQ7Z3C6 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATG9AQ7Z3C6 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATG9AQ7Z3C6 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATG9AQ7Z3C6 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATG9AQ7Z3C6 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATG9AQ7Z3C6 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATG9AQ7Z3C6 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATG9AQ7Z3C6 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATG9AQ7Z3C6 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATG9AQ7Z3C6 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATG9AQ7Z3C6 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATG9AQ7Z3C6 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATG9AQ7Z3C6 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATG9AQ7Z3C6 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ATG9AQ7Z3C6 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATG9AQ7Z3C6 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATG9AQ7Z3C6 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATG9AQ7Z3C6 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATG9AQ7Z3C6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATG9AQ7Z3C6 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATG9AQ7Z3C6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATG9AQ7Z3C6 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATG9AQ7Z3C6 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATG9AQ7Z3C6 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATG9AQ7Z3C6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATG9AQ7Z3C6 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATG9AQ7Z3C6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATG9AQ7Z3C6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATG9AQ7Z3C6 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATG9AQ7Z3C6 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATG9AQ7Z3C6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATG9AQ7Z3C6 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATG9AQ7Z3C6 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATG9AQ7Z3C6 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATG9AQ7Z3C6 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATG9AQ7Z3C6 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATG9AQ7Z3C6 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATG9AQ7Z3C6 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATG9AQ7Z3C6 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATG9AQ7Z3C6 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATG9AQ7Z3C6 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ATG9AQ7Z3C6 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATG9AQ7Z3C6 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ATG9AQ7Z3C6 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATG9AQ7Z3C6 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATG9AQ7Z3C6 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATG9AQ7Z3C6 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATG9AQ7Z3C6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATG9AQ7Z3C6 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATG9AQ7Z3C6 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATG9AQ7Z3C6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATG9AQ7Z3C6 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATG9AQ7Z3C6 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATG9AQ7Z3C6 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATG9AQ7Z3C6 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATG9AQ7Z3C6 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATG9AQ7Z3C6 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATG9AQ7Z3C6 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATG9AQ7Z3C6 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATG9AQ7Z3C6 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATG9AQ7Z3C6 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATG9AQ7Z3C6 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATG9AQ7Z3C6 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATG9AQ7Z3C6 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATG9AQ7Z3C6 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ATG9AQ7Z3C6 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATG9AQ7Z3C6 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ATG9AQ7Z3C6 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATG9AQ7Z3C6 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ATG9AQ7Z3C6 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATG9AQ7Z3C6 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATG9AQ7Z3C6 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATG9AQ7Z3C6 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATG9AQ7Z3C6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATG9AQ7Z3C6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATG9AQ7Z3C6 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATG9AQ7Z3C6 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATG9AQ7Z3C6 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATG9AQ7Z3C6 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATG9AQ7Z3C6 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms