Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTF1AQ7RTS3 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTF1AQ7RTS3 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTF1AQ7RTS3 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTF1AQ7RTS3 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTF1AQ7RTS3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTF1AQ7RTS3 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTF1AQ7RTS3 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTF1AQ7RTS3 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTF1AQ7RTS3 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTF1AQ7RTS3 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTF1AQ7RTS3 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PTF1AQ7RTS3 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTF1AQ7RTS3 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTF1AQ7RTS3 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTF1AQ7RTS3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTF1AQ7RTS3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTF1AQ7RTS3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTF1AQ7RTS3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTF1AQ7RTS3 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTF1AQ7RTS3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTF1AQ7RTS3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTF1AQ7RTS3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTF1AQ7RTS3 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PTF1AQ7RTS3 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTF1AQ7RTS3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTF1AQ7RTS3 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTF1AQ7RTS3 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PTF1AQ7RTS3 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTF1AQ7RTS3 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PTF1AQ7RTS3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTF1AQ7RTS3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTF1AQ7RTS3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTF1AQ7RTS3 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTF1AQ7RTS3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTF1AQ7RTS3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTF1AQ7RTS3 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTF1AQ7RTS3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTF1AQ7RTS3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTF1AQ7RTS3 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTF1AQ7RTS3 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTF1AQ7RTS3 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTF1AQ7RTS3 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTF1AQ7RTS3 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTF1AQ7RTS3 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTF1AQ7RTS3 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTF1AQ7RTS3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTF1AQ7RTS3 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTF1AQ7RTS3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTF1AQ7RTS3 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTF1AQ7RTS3 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PTF1AQ7RTS3 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTF1AQ7RTS3 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTF1AQ7RTS3 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTF1AQ7RTS3 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTF1AQ7RTS3 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTF1AQ7RTS3 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTF1AQ7RTS3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTF1AQ7RTS3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTF1AQ7RTS3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTF1AQ7RTS3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTF1AQ7RTS3 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PTF1AQ7RTS3 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTF1AQ7RTS3 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTF1AQ7RTS3 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTF1AQ7RTS3 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PTF1AQ7RTS3 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTF1AQ7RTS3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTF1AQ7RTS3 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PTF1AQ7RTS3 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTF1AQ7RTS3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTF1AQ7RTS3 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTF1AQ7RTS3 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PTF1AQ7RTS3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTF1AQ7RTS3 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTF1AQ7RTS3 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTF1AQ7RTS3 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTF1AQ7RTS3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTF1AQ7RTS3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTF1AQ7RTS3 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTF1AQ7RTS3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTF1AQ7RTS3 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTF1AQ7RTS3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTF1AQ7RTS3 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTF1AQ7RTS3 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTF1AQ7RTS3 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTF1AQ7RTS3 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTF1AQ7RTS3 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTF1AQ7RTS3 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTF1AQ7RTS3 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTF1AQ7RTS3 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PTF1AQ7RTS3 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTF1AQ7RTS3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTF1AQ7RTS3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTF1AQ7RTS3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTF1AQ7RTS3 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTF1AQ7RTS3 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTF1AQ7RTS3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTF1AQ7RTS3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTF1AQ7RTS3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms