Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL3

USP50, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 50, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP50Q70EL3 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP50Q70EL3 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP50Q70EL3 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP50Q70EL3 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP50Q70EL3 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
USP50Q70EL3 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP50Q70EL3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP50Q70EL3 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP50Q70EL3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
USP50Q70EL3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP50Q70EL3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP50Q70EL3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP50Q70EL3 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP50Q70EL3 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP50Q70EL3 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP50Q70EL3 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP50Q70EL3 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP50Q70EL3 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP50Q70EL3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP50Q70EL3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP50Q70EL3 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
USP50Q70EL3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP50Q70EL3 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP50Q70EL3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP50Q70EL3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP50Q70EL3 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP50Q70EL3 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP50Q70EL3 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP50Q70EL3 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP50Q70EL3 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
USP50Q70EL3 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP50Q70EL3 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP50Q70EL3 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP50Q70EL3 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP50Q70EL3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP50Q70EL3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP50Q70EL3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP50Q70EL3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP50Q70EL3 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP50Q70EL3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP50Q70EL3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP50Q70EL3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP50Q70EL3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP50Q70EL3 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP50Q70EL3 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP50Q70EL3 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP50Q70EL3 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP50Q70EL3 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP50Q70EL3 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP50Q70EL3 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP50Q70EL3 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP50Q70EL3 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP50Q70EL3 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP50Q70EL3 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP50Q70EL3 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP50Q70EL3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP50Q70EL3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP50Q70EL3 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP50Q70EL3 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP50Q70EL3 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP50Q70EL3 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP50Q70EL3 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
USP50Q70EL3 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP50Q70EL3 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP50Q70EL3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP50Q70EL3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP50Q70EL3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP50Q70EL3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP50Q70EL3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP50Q70EL3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP50Q70EL3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP50Q70EL3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP50Q70EL3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP50Q70EL3 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP50Q70EL3 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP50Q70EL3 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP50Q70EL3 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP50Q70EL3 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP50Q70EL3 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
USP50Q70EL3 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP50Q70EL3 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP50Q70EL3 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP50Q70EL3 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
USP50Q70EL3 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
USP50Q70EL3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP50Q70EL3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
USP50Q70EL3 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP50Q70EL3 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP50Q70EL3 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP50Q70EL3 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP50Q70EL3 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
USP50Q70EL3 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
USP50Q70EL3 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
USP50Q70EL3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP50Q70EL3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP50Q70EL3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP50Q70EL3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP50Q70EL3 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP50Q70EL3 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP50Q70EL3 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
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