Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP31Q70CQ4 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP31Q70CQ4 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP31Q70CQ4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP31Q70CQ4 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP31Q70CQ4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP31Q70CQ4 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP31Q70CQ4 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP31Q70CQ4 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP31Q70CQ4 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP31Q70CQ4 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP31Q70CQ4 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP31Q70CQ4 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP31Q70CQ4 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP31Q70CQ4 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
USP31Q70CQ4 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP31Q70CQ4 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP31Q70CQ4 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP31Q70CQ4 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP31Q70CQ4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP31Q70CQ4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP31Q70CQ4 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP31Q70CQ4 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP31Q70CQ4 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP31Q70CQ4 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP31Q70CQ4 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP31Q70CQ4 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP31Q70CQ4 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP31Q70CQ4 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP31Q70CQ4 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP31Q70CQ4 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP31Q70CQ4 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
USP31Q70CQ4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP31Q70CQ4 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP31Q70CQ4 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP31Q70CQ4 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP31Q70CQ4 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP31Q70CQ4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP31Q70CQ4 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP31Q70CQ4 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP31Q70CQ4 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP31Q70CQ4 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
USP31Q70CQ4 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP31Q70CQ4 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
USP31Q70CQ4 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP31Q70CQ4 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP31Q70CQ4 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP31Q70CQ4 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
USP31Q70CQ4 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP31Q70CQ4 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP31Q70CQ4 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP31Q70CQ4 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP31Q70CQ4 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
USP31Q70CQ4 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
USP31Q70CQ4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP31Q70CQ4 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP31Q70CQ4 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP31Q70CQ4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
USP31Q70CQ4 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP31Q70CQ4 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP31Q70CQ4 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP31Q70CQ4 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP31Q70CQ4 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP31Q70CQ4 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP31Q70CQ4 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP31Q70CQ4 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
USP31Q70CQ4 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP31Q70CQ4 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP31Q70CQ4 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP31Q70CQ4 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP31Q70CQ4 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
USP31Q70CQ4 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP31Q70CQ4 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP31Q70CQ4 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP31Q70CQ4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP31Q70CQ4 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP31Q70CQ4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
USP31Q70CQ4 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP31Q70CQ4 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP31Q70CQ4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP31Q70CQ4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP31Q70CQ4 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP31Q70CQ4 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP31Q70CQ4 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
USP31Q70CQ4 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
USP31Q70CQ4 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP31Q70CQ4 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP31Q70CQ4 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
USP31Q70CQ4 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
USP31Q70CQ4 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
USP31Q70CQ4 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP31Q70CQ4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP31Q70CQ4 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
USP31Q70CQ4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
USP31Q70CQ4 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
USP31Q70CQ4 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP31Q70CQ4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP31Q70CQ4 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP31Q70CQ4 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP31Q70CQ4 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
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