Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW49

PAXIP1, PAX-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,069 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXIP1Q6ZW49 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PAXIP1Q6ZW49 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PAXIP1Q6ZW49 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PAXIP1Q6ZW49 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PAXIP1Q6ZW49 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PAXIP1Q6ZW49 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAXIP1Q6ZW49 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAXIP1Q6ZW49 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAXIP1Q6ZW49 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAXIP1Q6ZW49 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PAXIP1Q6ZW49 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAXIP1Q6ZW49 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PAXIP1Q6ZW49 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAXIP1Q6ZW49 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAXIP1Q6ZW49 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAXIP1Q6ZW49 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAXIP1Q6ZW49 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAXIP1Q6ZW49 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAXIP1Q6ZW49 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAXIP1Q6ZW49 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAXIP1Q6ZW49 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAXIP1Q6ZW49 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAXIP1Q6ZW49 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAXIP1Q6ZW49 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAXIP1Q6ZW49 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAXIP1Q6ZW49 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAXIP1Q6ZW49 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAXIP1Q6ZW49 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAXIP1Q6ZW49 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAXIP1Q6ZW49 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PAXIP1Q6ZW49 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAXIP1Q6ZW49 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAXIP1Q6ZW49 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAXIP1Q6ZW49 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAXIP1Q6ZW49 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAXIP1Q6ZW49 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAXIP1Q6ZW49 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAXIP1Q6ZW49 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAXIP1Q6ZW49 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAXIP1Q6ZW49 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAXIP1Q6ZW49 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAXIP1Q6ZW49 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAXIP1Q6ZW49 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAXIP1Q6ZW49 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAXIP1Q6ZW49 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAXIP1Q6ZW49 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAXIP1Q6ZW49 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAXIP1Q6ZW49 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PAXIP1Q6ZW49 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAXIP1Q6ZW49 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PAXIP1Q6ZW49 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAXIP1Q6ZW49 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAXIP1Q6ZW49 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAXIP1Q6ZW49 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAXIP1Q6ZW49 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PAXIP1Q6ZW49 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAXIP1Q6ZW49 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAXIP1Q6ZW49 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAXIP1Q6ZW49 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAXIP1Q6ZW49 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAXIP1Q6ZW49 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAXIP1Q6ZW49 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAXIP1Q6ZW49 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAXIP1Q6ZW49 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAXIP1Q6ZW49 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAXIP1Q6ZW49 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAXIP1Q6ZW49 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAXIP1Q6ZW49 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAXIP1Q6ZW49 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAXIP1Q6ZW49 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAXIP1Q6ZW49 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAXIP1Q6ZW49 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAXIP1Q6ZW49 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAXIP1Q6ZW49 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAXIP1Q6ZW49 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PAXIP1Q6ZW49 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAXIP1Q6ZW49 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAXIP1Q6ZW49 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAXIP1Q6ZW49 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAXIP1Q6ZW49 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAXIP1Q6ZW49 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAXIP1Q6ZW49 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAXIP1Q6ZW49 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAXIP1Q6ZW49 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAXIP1Q6ZW49 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAXIP1Q6ZW49 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAXIP1Q6ZW49 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAXIP1Q6ZW49 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAXIP1Q6ZW49 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PAXIP1Q6ZW49 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAXIP1Q6ZW49 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAXIP1Q6ZW49 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PAXIP1Q6ZW49 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAXIP1Q6ZW49 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAXIP1Q6ZW49 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAXIP1Q6ZW49 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAXIP1Q6ZW49 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAXIP1Q6ZW49 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAXIP1Q6ZW49 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAXIP1Q6ZW49 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms