Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVK1

TMEM179, Transmembrane protein 179, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM179Q6ZVK1 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM179Q6ZVK1 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM179Q6ZVK1 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM179Q6ZVK1 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM179Q6ZVK1 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM179Q6ZVK1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM179Q6ZVK1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM179Q6ZVK1 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM179Q6ZVK1 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM179Q6ZVK1 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM179Q6ZVK1 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM179Q6ZVK1 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM179Q6ZVK1 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM179Q6ZVK1 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM179Q6ZVK1 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM179Q6ZVK1 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM179Q6ZVK1 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM179Q6ZVK1 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM179Q6ZVK1 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM179Q6ZVK1 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM179Q6ZVK1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM179Q6ZVK1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM179Q6ZVK1 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM179Q6ZVK1 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM179Q6ZVK1 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM179Q6ZVK1 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM179Q6ZVK1 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM179Q6ZVK1 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM179Q6ZVK1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMEM179Q6ZVK1 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMEM179Q6ZVK1 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMEM179Q6ZVK1 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMEM179Q6ZVK1 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
TMEM179Q6ZVK1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMEM179Q6ZVK1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM179Q6ZVK1 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM179Q6ZVK1 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM179Q6ZVK1 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM179Q6ZVK1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM179Q6ZVK1 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM179Q6ZVK1 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM179Q6ZVK1 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM179Q6ZVK1 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM179Q6ZVK1 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM179Q6ZVK1 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM179Q6ZVK1 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM179Q6ZVK1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM179Q6ZVK1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM179Q6ZVK1 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM179Q6ZVK1 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM179Q6ZVK1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM179Q6ZVK1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM179Q6ZVK1 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM179Q6ZVK1 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM179Q6ZVK1 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM179Q6ZVK1 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM179Q6ZVK1 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM179Q6ZVK1 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM179Q6ZVK1 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM179Q6ZVK1 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM179Q6ZVK1 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM179Q6ZVK1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM179Q6ZVK1 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM179Q6ZVK1 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM179Q6ZVK1 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM179Q6ZVK1 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM179Q6ZVK1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM179Q6ZVK1 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM179Q6ZVK1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM179Q6ZVK1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM179Q6ZVK1 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM179Q6ZVK1 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM179Q6ZVK1 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM179Q6ZVK1 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM179Q6ZVK1 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM179Q6ZVK1 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM179Q6ZVK1 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM179Q6ZVK1 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM179Q6ZVK1 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM179Q6ZVK1 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM179Q6ZVK1 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM179Q6ZVK1 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM179Q6ZVK1 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM179Q6ZVK1 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM179Q6ZVK1 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM179Q6ZVK1 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM179Q6ZVK1 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM179Q6ZVK1 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM179Q6ZVK1 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM179Q6ZVK1 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM179Q6ZVK1 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM179Q6ZVK1 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM179Q6ZVK1 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM179Q6ZVK1 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM179Q6ZVK1 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM179Q6ZVK1 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM179Q6ZVK1 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM179Q6ZVK1 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM179Q6ZVK1 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM179Q6ZVK1 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms