Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV65

FAM47E, Protein FAM47E, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47EQ6ZV65 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM47EQ6ZV65 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms