Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQX7

LIAT1, Protein LIAT1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIAT1Q6ZQX7 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LIAT1Q6ZQX7 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LIAT1Q6ZQX7 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LIAT1Q6ZQX7 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LIAT1Q6ZQX7 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LIAT1Q6ZQX7 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LIAT1Q6ZQX7 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LIAT1Q6ZQX7 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LIAT1Q6ZQX7 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LIAT1Q6ZQX7 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LIAT1Q6ZQX7 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LIAT1Q6ZQX7 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIAT1Q6ZQX7 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIAT1Q6ZQX7 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIAT1Q6ZQX7 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIAT1Q6ZQX7 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIAT1Q6ZQX7 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIAT1Q6ZQX7 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIAT1Q6ZQX7 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIAT1Q6ZQX7 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIAT1Q6ZQX7 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIAT1Q6ZQX7 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIAT1Q6ZQX7 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LIAT1Q6ZQX7 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIAT1Q6ZQX7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIAT1Q6ZQX7 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIAT1Q6ZQX7 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIAT1Q6ZQX7 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIAT1Q6ZQX7 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LIAT1Q6ZQX7 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIAT1Q6ZQX7 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIAT1Q6ZQX7 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIAT1Q6ZQX7 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LIAT1Q6ZQX7 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LIAT1Q6ZQX7 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LIAT1Q6ZQX7 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LIAT1Q6ZQX7 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LIAT1Q6ZQX7 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LIAT1Q6ZQX7 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LIAT1Q6ZQX7 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LIAT1Q6ZQX7 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LIAT1Q6ZQX7 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LIAT1Q6ZQX7 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LIAT1Q6ZQX7 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LIAT1Q6ZQX7 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LIAT1Q6ZQX7 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LIAT1Q6ZQX7 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LIAT1Q6ZQX7 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LIAT1Q6ZQX7 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LIAT1Q6ZQX7 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LIAT1Q6ZQX7 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LIAT1Q6ZQX7 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LIAT1Q6ZQX7 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LIAT1Q6ZQX7 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LIAT1Q6ZQX7 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LIAT1Q6ZQX7 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LIAT1Q6ZQX7 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LIAT1Q6ZQX7 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LIAT1Q6ZQX7 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LIAT1Q6ZQX7 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LIAT1Q6ZQX7 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LIAT1Q6ZQX7 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LIAT1Q6ZQX7 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LIAT1Q6ZQX7 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LIAT1Q6ZQX7 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LIAT1Q6ZQX7 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LIAT1Q6ZQX7 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LIAT1Q6ZQX7 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LIAT1Q6ZQX7 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LIAT1Q6ZQX7 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LIAT1Q6ZQX7 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LIAT1Q6ZQX7 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LIAT1Q6ZQX7 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LIAT1Q6ZQX7 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LIAT1Q6ZQX7 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LIAT1Q6ZQX7 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LIAT1Q6ZQX7 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LIAT1Q6ZQX7 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LIAT1Q6ZQX7 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LIAT1Q6ZQX7 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LIAT1Q6ZQX7 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LIAT1Q6ZQX7 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LIAT1Q6ZQX7 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LIAT1Q6ZQX7 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LIAT1Q6ZQX7 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LIAT1Q6ZQX7 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LIAT1Q6ZQX7 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LIAT1Q6ZQX7 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LIAT1Q6ZQX7 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LIAT1Q6ZQX7 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LIAT1Q6ZQX7 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LIAT1Q6ZQX7 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LIAT1Q6ZQX7 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LIAT1Q6ZQX7 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LIAT1Q6ZQX7 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LIAT1Q6ZQX7 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LIAT1Q6ZQX7 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LIAT1Q6ZQX7 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LIAT1Q6ZQX7 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LIAT1Q6ZQX7 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms