Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXD4L3Q6VB84 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms