Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9F0

CCDC62, Coiled-coil domain-containing protein 62, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC62Q6P9F0 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC62Q6P9F0 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC62Q6P9F0 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC62Q6P9F0 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC62Q6P9F0 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC62Q6P9F0 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC62Q6P9F0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC62Q6P9F0 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC62Q6P9F0 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC62Q6P9F0 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC62Q6P9F0 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC62Q6P9F0 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC62Q6P9F0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC62Q6P9F0 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC62Q6P9F0 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC62Q6P9F0 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC62Q6P9F0 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC62Q6P9F0 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC62Q6P9F0 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC62Q6P9F0 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC62Q6P9F0 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC62Q6P9F0 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC62Q6P9F0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC62Q6P9F0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC62Q6P9F0 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC62Q6P9F0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC62Q6P9F0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC62Q6P9F0 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC62Q6P9F0 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC62Q6P9F0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC62Q6P9F0 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC62Q6P9F0 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC62Q6P9F0 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC62Q6P9F0 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC62Q6P9F0 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC62Q6P9F0 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC62Q6P9F0 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC62Q6P9F0 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC62Q6P9F0 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC62Q6P9F0 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC62Q6P9F0 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC62Q6P9F0 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC62Q6P9F0 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC62Q6P9F0 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC62Q6P9F0 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC62Q6P9F0 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC62Q6P9F0 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC62Q6P9F0 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC62Q6P9F0 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC62Q6P9F0 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC62Q6P9F0 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC62Q6P9F0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC62Q6P9F0 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC62Q6P9F0 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC62Q6P9F0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms