Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Q4

LMOD2, Leiomodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD2Q6P5Q4 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LMOD2Q6P5Q4 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
LMOD2Q6P5Q4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LMOD2Q6P5Q4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LMOD2Q6P5Q4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LMOD2Q6P5Q4 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LMOD2Q6P5Q4 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LMOD2Q6P5Q4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LMOD2Q6P5Q4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LMOD2Q6P5Q4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LMOD2Q6P5Q4 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
LMOD2Q6P5Q4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LMOD2Q6P5Q4 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LMOD2Q6P5Q4 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LMOD2Q6P5Q4 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LMOD2Q6P5Q4 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LMOD2Q6P5Q4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LMOD2Q6P5Q4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LMOD2Q6P5Q4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LMOD2Q6P5Q4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LMOD2Q6P5Q4 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LMOD2Q6P5Q4 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LMOD2Q6P5Q4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LMOD2Q6P5Q4 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LMOD2Q6P5Q4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LMOD2Q6P5Q4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
LMOD2Q6P5Q4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMOD2Q6P5Q4 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMOD2Q6P5Q4 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMOD2Q6P5Q4 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
LMOD2Q6P5Q4 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMOD2Q6P5Q4 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMOD2Q6P5Q4 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMOD2Q6P5Q4 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMOD2Q6P5Q4 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMOD2Q6P5Q4 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMOD2Q6P5Q4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMOD2Q6P5Q4 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
LMOD2Q6P5Q4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMOD2Q6P5Q4 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMOD2Q6P5Q4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LMOD2Q6P5Q4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LMOD2Q6P5Q4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LMOD2Q6P5Q4 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LMOD2Q6P5Q4 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LMOD2Q6P5Q4 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LMOD2Q6P5Q4 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LMOD2Q6P5Q4 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
LMOD2Q6P5Q4 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LMOD2Q6P5Q4 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LMOD2Q6P5Q4 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LMOD2Q6P5Q4 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
LMOD2Q6P5Q4 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LMOD2Q6P5Q4 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LMOD2Q6P5Q4 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LMOD2Q6P5Q4 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LMOD2Q6P5Q4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LMOD2Q6P5Q4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMOD2Q6P5Q4 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMOD2Q6P5Q4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMOD2Q6P5Q4 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMOD2Q6P5Q4 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMOD2Q6P5Q4 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMOD2Q6P5Q4 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMOD2Q6P5Q4 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
LMOD2Q6P5Q4 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMOD2Q6P5Q4 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMOD2Q6P5Q4 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMOD2Q6P5Q4 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMOD2Q6P5Q4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMOD2Q6P5Q4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMOD2Q6P5Q4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LMOD2Q6P5Q4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LMOD2Q6P5Q4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LMOD2Q6P5Q4 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LMOD2Q6P5Q4 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
LMOD2Q6P5Q4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LMOD2Q6P5Q4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LMOD2Q6P5Q4 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LMOD2Q6P5Q4 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LMOD2Q6P5Q4 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
LMOD2Q6P5Q4 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LMOD2Q6P5Q4 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LMOD2Q6P5Q4 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LMOD2Q6P5Q4 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LMOD2Q6P5Q4 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LMOD2Q6P5Q4 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LMOD2Q6P5Q4 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LMOD2Q6P5Q4 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
LMOD2Q6P5Q4 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LMOD2Q6P5Q4 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
LMOD2Q6P5Q4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
LMOD2Q6P5Q4 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
LMOD2Q6P5Q4 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
LMOD2Q6P5Q4 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMOD2Q6P5Q4 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
LMOD2Q6P5Q4 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMOD2Q6P5Q4 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMOD2Q6P5Q4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMOD2Q6P5Q4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms