Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ANKRD54Q6NXT1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ANKRD54Q6NXT1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ANKRD54Q6NXT1 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ANKRD54Q6NXT1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ANKRD54Q6NXT1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ANKRD54Q6NXT1 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ANKRD54Q6NXT1 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ANKRD54Q6NXT1 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms