Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms