Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPPQ6IPU0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPPQ6IPU0 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPPQ6IPU0 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPPQ6IPU0 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPPQ6IPU0 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPPQ6IPU0 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPPQ6IPU0 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPPQ6IPU0 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPPQ6IPU0 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPPQ6IPU0 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPPQ6IPU0 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPPQ6IPU0 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPPQ6IPU0 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPPQ6IPU0 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPPQ6IPU0 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPPQ6IPU0 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPPQ6IPU0 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPPQ6IPU0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPPQ6IPU0 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPPQ6IPU0 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPPQ6IPU0 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPPQ6IPU0 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPPQ6IPU0 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPPQ6IPU0 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPPQ6IPU0 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPPQ6IPU0 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPPQ6IPU0 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPPQ6IPU0 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPPQ6IPU0 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPPQ6IPU0 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPPQ6IPU0 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPPQ6IPU0 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPPQ6IPU0 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPPQ6IPU0 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPPQ6IPU0 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPPQ6IPU0 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPPQ6IPU0 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPPQ6IPU0 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPPQ6IPU0 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPPQ6IPU0 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPPQ6IPU0 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPPQ6IPU0 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPPQ6IPU0 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPPQ6IPU0 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPPQ6IPU0 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPPQ6IPU0 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPPQ6IPU0 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPPQ6IPU0 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPPQ6IPU0 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPPQ6IPU0 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPPQ6IPU0 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPPQ6IPU0 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPPQ6IPU0 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CENPPQ6IPU0 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPPQ6IPU0 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPPQ6IPU0 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPPQ6IPU0 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPPQ6IPU0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPPQ6IPU0 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPPQ6IPU0 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPPQ6IPU0 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPPQ6IPU0 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPPQ6IPU0 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPPQ6IPU0 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPPQ6IPU0 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPPQ6IPU0 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPPQ6IPU0 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPPQ6IPU0 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPPQ6IPU0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPPQ6IPU0 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPPQ6IPU0 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CENPPQ6IPU0 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CENPPQ6IPU0 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CENPPQ6IPU0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CENPPQ6IPU0 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CENPPQ6IPU0 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CENPPQ6IPU0 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CENPPQ6IPU0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CENPPQ6IPU0 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CENPPQ6IPU0 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CENPPQ6IPU0 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CENPPQ6IPU0 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CENPPQ6IPU0 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CENPPQ6IPU0 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CENPPQ6IPU0 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CENPPQ6IPU0 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CENPPQ6IPU0 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CENPPQ6IPU0 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CENPPQ6IPU0 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CENPPQ6IPU0 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CENPPQ6IPU0 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CENPPQ6IPU0 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CENPPQ6IPU0 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CENPPQ6IPU0 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CENPPQ6IPU0 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CENPPQ6IPU0 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CENPPQ6IPU0 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CENPPQ6IPU0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CENPPQ6IPU0 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms