Protein–RNA interactions for Protein: Q6GMV2

SMYD5, SET and MYND domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD5Q6GMV2 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMYD5Q6GMV2 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SMYD5Q6GMV2 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SMYD5Q6GMV2 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SMYD5Q6GMV2 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMYD5Q6GMV2 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMYD5Q6GMV2 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMYD5Q6GMV2 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMYD5Q6GMV2 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMYD5Q6GMV2 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMYD5Q6GMV2 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMYD5Q6GMV2 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMYD5Q6GMV2 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMYD5Q6GMV2 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMYD5Q6GMV2 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMYD5Q6GMV2 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMYD5Q6GMV2 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMYD5Q6GMV2 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMYD5Q6GMV2 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMYD5Q6GMV2 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMYD5Q6GMV2 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMYD5Q6GMV2 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMYD5Q6GMV2 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMYD5Q6GMV2 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMYD5Q6GMV2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMYD5Q6GMV2 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMYD5Q6GMV2 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMYD5Q6GMV2 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMYD5Q6GMV2 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms