Protein–RNA interactions for Protein: Q66GS9

CEP135, Centrosomal protein of 135 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP135Q66GS9 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP135Q66GS9 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP135Q66GS9 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP135Q66GS9 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP135Q66GS9 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP135Q66GS9 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP135Q66GS9 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP135Q66GS9 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP135Q66GS9 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP135Q66GS9 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP135Q66GS9 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP135Q66GS9 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP135Q66GS9 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP135Q66GS9 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP135Q66GS9 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP135Q66GS9 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP135Q66GS9 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP135Q66GS9 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP135Q66GS9 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP135Q66GS9 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP135Q66GS9 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP135Q66GS9 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP135Q66GS9 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP135Q66GS9 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP135Q66GS9 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP135Q66GS9 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP135Q66GS9 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP135Q66GS9 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP135Q66GS9 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP135Q66GS9 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP135Q66GS9 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP135Q66GS9 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP135Q66GS9 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP135Q66GS9 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP135Q66GS9 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP135Q66GS9 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP135Q66GS9 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEP135Q66GS9 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEP135Q66GS9 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEP135Q66GS9 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEP135Q66GS9 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEP135Q66GS9 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEP135Q66GS9 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEP135Q66GS9 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEP135Q66GS9 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEP135Q66GS9 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEP135Q66GS9 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP135Q66GS9 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP135Q66GS9 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP135Q66GS9 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP135Q66GS9 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP135Q66GS9 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP135Q66GS9 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP135Q66GS9 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP135Q66GS9 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP135Q66GS9 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP135Q66GS9 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP135Q66GS9 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP135Q66GS9 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP135Q66GS9 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP135Q66GS9 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP135Q66GS9 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP135Q66GS9 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP135Q66GS9 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP135Q66GS9 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP135Q66GS9 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP135Q66GS9 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP135Q66GS9 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP135Q66GS9 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP135Q66GS9 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEP135Q66GS9 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEP135Q66GS9 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEP135Q66GS9 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEP135Q66GS9 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEP135Q66GS9 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEP135Q66GS9 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEP135Q66GS9 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CEP135Q66GS9 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CEP135Q66GS9 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEP135Q66GS9 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEP135Q66GS9 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEP135Q66GS9 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEP135Q66GS9 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEP135Q66GS9 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEP135Q66GS9 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEP135Q66GS9 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEP135Q66GS9 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEP135Q66GS9 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEP135Q66GS9 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEP135Q66GS9 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEP135Q66GS9 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEP135Q66GS9 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CEP135Q66GS9 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CEP135Q66GS9 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CEP135Q66GS9 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CEP135Q66GS9 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CEP135Q66GS9 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CEP135Q66GS9 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CEP135Q66GS9 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CEP135Q66GS9 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms