Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.27■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
WSCD1Q658N2 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
WSCD1Q658N2 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
WSCD1Q658N2 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
WSCD1Q658N2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
WSCD1Q658N2 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
WSCD1Q658N2 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
WSCD1Q658N2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
WSCD1Q658N2 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
WSCD1Q658N2 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
WSCD1Q658N2 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
WSCD1Q658N2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
WSCD1Q658N2 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
WSCD1Q658N2 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
WSCD1Q658N2 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
WSCD1Q658N2 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
WSCD1Q658N2 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
WSCD1Q658N2 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
WSCD1Q658N2 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
WSCD1Q658N2 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
WSCD1Q658N2 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
WSCD1Q658N2 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
WSCD1Q658N2 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
WSCD1Q658N2 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
WSCD1Q658N2 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
WSCD1Q658N2 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
WSCD1Q658N2 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
WSCD1Q658N2 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
WSCD1Q658N2 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
WSCD1Q658N2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
WSCD1Q658N2 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
WSCD1Q658N2 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
WSCD1Q658N2 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
WSCD1Q658N2 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
WSCD1Q658N2 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
WSCD1Q658N2 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
WSCD1Q658N2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
WSCD1Q658N2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
WSCD1Q658N2 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
WSCD1Q658N2 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
WSCD1Q658N2 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
WSCD1Q658N2 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
WSCD1Q658N2 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
WSCD1Q658N2 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
WSCD1Q658N2 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
WSCD1Q658N2 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
WSCD1Q658N2 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
WSCD1Q658N2 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
WSCD1Q658N2 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
WSCD1Q658N2 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
WSCD1Q658N2 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
WSCD1Q658N2 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
WSCD1Q658N2 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
WSCD1Q658N2 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
WSCD1Q658N2 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
WSCD1Q658N2 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
WSCD1Q658N2 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
WSCD1Q658N2 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
WSCD1Q658N2 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
WSCD1Q658N2 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
WSCD1Q658N2 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
WSCD1Q658N2 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
WSCD1Q658N2 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
WSCD1Q658N2 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
WSCD1Q658N2 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
WSCD1Q658N2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
WSCD1Q658N2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
WSCD1Q658N2 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
WSCD1Q658N2 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
WSCD1Q658N2 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
WSCD1Q658N2 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
WSCD1Q658N2 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
WSCD1Q658N2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
WSCD1Q658N2 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
WSCD1Q658N2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
WSCD1Q658N2 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
WSCD1Q658N2 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
WSCD1Q658N2 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
WSCD1Q658N2 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
WSCD1Q658N2 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
WSCD1Q658N2 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
WSCD1Q658N2 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
WSCD1Q658N2 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
WSCD1Q658N2 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
WSCD1Q658N2 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
WSCD1Q658N2 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
WSCD1Q658N2 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
WSCD1Q658N2 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
WSCD1Q658N2 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
WSCD1Q658N2 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
WSCD1Q658N2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
WSCD1Q658N2 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
WSCD1Q658N2 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
WSCD1Q658N2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
WSCD1Q658N2 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms