Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWG9

TAF3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF3Q5VWG9 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF3Q5VWG9 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms