Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
HES3Q5TGS1 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HES3Q5TGS1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HES3Q5TGS1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HES3Q5TGS1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HES3Q5TGS1 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HES3Q5TGS1 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HES3Q5TGS1 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HES3Q5TGS1 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HES3Q5TGS1 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HES3Q5TGS1 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HES3Q5TGS1 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HES3Q5TGS1 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HES3Q5TGS1 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HES3Q5TGS1 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HES3Q5TGS1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HES3Q5TGS1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HES3Q5TGS1 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HES3Q5TGS1 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HES3Q5TGS1 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HES3Q5TGS1 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
HES3Q5TGS1 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HES3Q5TGS1 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HES3Q5TGS1 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19■□□□□ 0.63
HES3Q5TGS1 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
HES3Q5TGS1 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
HES3Q5TGS1 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
HES3Q5TGS1 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HES3Q5TGS1 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HES3Q5TGS1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HES3Q5TGS1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HES3Q5TGS1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HES3Q5TGS1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HES3Q5TGS1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HES3Q5TGS1 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HES3Q5TGS1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HES3Q5TGS1 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HES3Q5TGS1 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19■□□□□ 0.63
HES3Q5TGS1 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HES3Q5TGS1 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HES3Q5TGS1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HES3Q5TGS1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HES3Q5TGS1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HES3Q5TGS1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HES3Q5TGS1 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HES3Q5TGS1 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HES3Q5TGS1 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HES3Q5TGS1 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HES3Q5TGS1 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HES3Q5TGS1 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HES3Q5TGS1 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HES3Q5TGS1 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HES3Q5TGS1 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HES3Q5TGS1 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HES3Q5TGS1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HES3Q5TGS1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HES3Q5TGS1 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HES3Q5TGS1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HES3Q5TGS1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HES3Q5TGS1 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HES3Q5TGS1 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HES3Q5TGS1 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HES3Q5TGS1 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HES3Q5TGS1 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HES3Q5TGS1 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HES3Q5TGS1 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HES3Q5TGS1 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HES3Q5TGS1 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HES3Q5TGS1 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HES3Q5TGS1 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HES3Q5TGS1 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HES3Q5TGS1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HES3Q5TGS1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HES3Q5TGS1 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HES3Q5TGS1 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HES3Q5TGS1 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HES3Q5TGS1 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HES3Q5TGS1 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HES3Q5TGS1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HES3Q5TGS1 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HES3Q5TGS1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HES3Q5TGS1 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HES3Q5TGS1 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms