Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PXDC1Q5TGL8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PXDC1Q5TGL8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PXDC1Q5TGL8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PXDC1Q5TGL8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PXDC1Q5TGL8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PXDC1Q5TGL8 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PXDC1Q5TGL8 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PXDC1Q5TGL8 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PXDC1Q5TGL8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PXDC1Q5TGL8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PXDC1Q5TGL8 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PXDC1Q5TGL8 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PXDC1Q5TGL8 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PXDC1Q5TGL8 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PXDC1Q5TGL8 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PXDC1Q5TGL8 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PXDC1Q5TGL8 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PXDC1Q5TGL8 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PXDC1Q5TGL8 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PXDC1Q5TGL8 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PXDC1Q5TGL8 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PXDC1Q5TGL8 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PXDC1Q5TGL8 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PXDC1Q5TGL8 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PXDC1Q5TGL8 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PXDC1Q5TGL8 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PXDC1Q5TGL8 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PXDC1Q5TGL8 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PXDC1Q5TGL8 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms