Protein–RNA interactions for Protein: Q5TDP6

LGSN, Lengsin, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGSNQ5TDP6 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LGSNQ5TDP6 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LGSNQ5TDP6 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LGSNQ5TDP6 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
LGSNQ5TDP6 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LGSNQ5TDP6 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LGSNQ5TDP6 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LGSNQ5TDP6 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LGSNQ5TDP6 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LGSNQ5TDP6 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LGSNQ5TDP6 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LGSNQ5TDP6 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LGSNQ5TDP6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LGSNQ5TDP6 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LGSNQ5TDP6 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LGSNQ5TDP6 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LGSNQ5TDP6 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LGSNQ5TDP6 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LGSNQ5TDP6 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LGSNQ5TDP6 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LGSNQ5TDP6 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LGSNQ5TDP6 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LGSNQ5TDP6 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LGSNQ5TDP6 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LGSNQ5TDP6 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LGSNQ5TDP6 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LGSNQ5TDP6 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LGSNQ5TDP6 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LGSNQ5TDP6 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LGSNQ5TDP6 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LGSNQ5TDP6 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LGSNQ5TDP6 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LGSNQ5TDP6 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LGSNQ5TDP6 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.5 ms