Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
FRMPD1Q5SYB0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
FRMPD1Q5SYB0 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
FRMPD1Q5SYB0 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
FRMPD1Q5SYB0 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
FRMPD1Q5SYB0 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
FRMPD1Q5SYB0 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
FRMPD1Q5SYB0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
FRMPD1Q5SYB0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
FRMPD1Q5SYB0 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
FRMPD1Q5SYB0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
FRMPD1Q5SYB0 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
FRMPD1Q5SYB0 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
FRMPD1Q5SYB0 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
FRMPD1Q5SYB0 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC30.16■■■□□ 2.42
FRMPD1Q5SYB0 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
FRMPD1Q5SYB0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
FRMPD1Q5SYB0 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
FRMPD1Q5SYB0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
FRMPD1Q5SYB0 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
FRMPD1Q5SYB0 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
FRMPD1Q5SYB0 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
FRMPD1Q5SYB0 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
FRMPD1Q5SYB0 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
FRMPD1Q5SYB0 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
FRMPD1Q5SYB0 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
FRMPD1Q5SYB0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
FRMPD1Q5SYB0 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
FRMPD1Q5SYB0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
FRMPD1Q5SYB0 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
FRMPD1Q5SYB0 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
FRMPD1Q5SYB0 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
FRMPD1Q5SYB0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
FRMPD1Q5SYB0 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
FRMPD1Q5SYB0 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
FRMPD1Q5SYB0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
FRMPD1Q5SYB0 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
FRMPD1Q5SYB0 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
FRMPD1Q5SYB0 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
FRMPD1Q5SYB0 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
FRMPD1Q5SYB0 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
FRMPD1Q5SYB0 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
FRMPD1Q5SYB0 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC30.13■■■□□ 2.41
FRMPD1Q5SYB0 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
FRMPD1Q5SYB0 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
FRMPD1Q5SYB0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
FRMPD1Q5SYB0 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
FRMPD1Q5SYB0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
FRMPD1Q5SYB0 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
FRMPD1Q5SYB0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
FRMPD1Q5SYB0 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
FRMPD1Q5SYB0 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
FRMPD1Q5SYB0 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
FRMPD1Q5SYB0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
FRMPD1Q5SYB0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
FRMPD1Q5SYB0 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
FRMPD1Q5SYB0 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
FRMPD1Q5SYB0 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
FRMPD1Q5SYB0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
FRMPD1Q5SYB0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
FRMPD1Q5SYB0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
FRMPD1Q5SYB0 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
FRMPD1Q5SYB0 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
FRMPD1Q5SYB0 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
FRMPD1Q5SYB0 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
FRMPD1Q5SYB0 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
FRMPD1Q5SYB0 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
FRMPD1Q5SYB0 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
FRMPD1Q5SYB0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
FRMPD1Q5SYB0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
FRMPD1Q5SYB0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
FRMPD1Q5SYB0 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
FRMPD1Q5SYB0 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
FRMPD1Q5SYB0 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
FRMPD1Q5SYB0 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
FRMPD1Q5SYB0 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
FRMPD1Q5SYB0 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
FRMPD1Q5SYB0 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
FRMPD1Q5SYB0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
FRMPD1Q5SYB0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
FRMPD1Q5SYB0 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
FRMPD1Q5SYB0 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
FRMPD1Q5SYB0 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
FRMPD1Q5SYB0 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
FRMPD1Q5SYB0 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.1■■■□□ 2.41
FRMPD1Q5SYB0 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC30.1■■■□□ 2.41
FRMPD1Q5SYB0 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
FRMPD1Q5SYB0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
FRMPD1Q5SYB0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
FRMPD1Q5SYB0 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
FRMPD1Q5SYB0 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
FRMPD1Q5SYB0 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
FRMPD1Q5SYB0 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
FRMPD1Q5SYB0 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
FRMPD1Q5SYB0 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
FRMPD1Q5SYB0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
FRMPD1Q5SYB0 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
FRMPD1Q5SYB0 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
FRMPD1Q5SYB0 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
FRMPD1Q5SYB0 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms