Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PCID2Q5JVF3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PCID2Q5JVF3 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PCID2Q5JVF3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PCID2Q5JVF3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCID2Q5JVF3 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCID2Q5JVF3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCID2Q5JVF3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCID2Q5JVF3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCID2Q5JVF3 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCID2Q5JVF3 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCID2Q5JVF3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PCID2Q5JVF3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCID2Q5JVF3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCID2Q5JVF3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCID2Q5JVF3 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCID2Q5JVF3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCID2Q5JVF3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCID2Q5JVF3 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCID2Q5JVF3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCID2Q5JVF3 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCID2Q5JVF3 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCID2Q5JVF3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCID2Q5JVF3 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCID2Q5JVF3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PCID2Q5JVF3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PCID2Q5JVF3 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PCID2Q5JVF3 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PCID2Q5JVF3 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PCID2Q5JVF3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PCID2Q5JVF3 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PCID2Q5JVF3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PCID2Q5JVF3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PCID2Q5JVF3 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PCID2Q5JVF3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PCID2Q5JVF3 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PCID2Q5JVF3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PCID2Q5JVF3 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PCID2Q5JVF3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PCID2Q5JVF3 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PCID2Q5JVF3 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PCID2Q5JVF3 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PCID2Q5JVF3 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PCID2Q5JVF3 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PCID2Q5JVF3 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PCID2Q5JVF3 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PCID2Q5JVF3 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PCID2Q5JVF3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PCID2Q5JVF3 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms