Protein–RNA interactions for Protein: Q5JV73

FRMPD3, FERM and PDZ domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,810 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD3Q5JV73 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
FRMPD3Q5JV73 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FRMPD3Q5JV73 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FRMPD3Q5JV73 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FRMPD3Q5JV73 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FRMPD3Q5JV73 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FRMPD3Q5JV73 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FRMPD3Q5JV73 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FRMPD3Q5JV73 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FRMPD3Q5JV73 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FRMPD3Q5JV73 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FRMPD3Q5JV73 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FRMPD3Q5JV73 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FRMPD3Q5JV73 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FRMPD3Q5JV73 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FRMPD3Q5JV73 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FRMPD3Q5JV73 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FRMPD3Q5JV73 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FRMPD3Q5JV73 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FRMPD3Q5JV73 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FRMPD3Q5JV73 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FRMPD3Q5JV73 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FRMPD3Q5JV73 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FRMPD3Q5JV73 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FRMPD3Q5JV73 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FRMPD3Q5JV73 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FRMPD3Q5JV73 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FRMPD3Q5JV73 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FRMPD3Q5JV73 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRMPD3Q5JV73 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRMPD3Q5JV73 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRMPD3Q5JV73 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms