Protein–RNA interactions for Protein: Q5GLZ8

HERC4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4Q5GLZ8 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERC4Q5GLZ8 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERC4Q5GLZ8 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERC4Q5GLZ8 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HERC4Q5GLZ8 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERC4Q5GLZ8 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERC4Q5GLZ8 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERC4Q5GLZ8 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERC4Q5GLZ8 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HERC4Q5GLZ8 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HERC4Q5GLZ8 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERC4Q5GLZ8 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERC4Q5GLZ8 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERC4Q5GLZ8 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERC4Q5GLZ8 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERC4Q5GLZ8 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERC4Q5GLZ8 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERC4Q5GLZ8 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERC4Q5GLZ8 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERC4Q5GLZ8 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERC4Q5GLZ8 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERC4Q5GLZ8 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERC4Q5GLZ8 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERC4Q5GLZ8 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERC4Q5GLZ8 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERC4Q5GLZ8 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERC4Q5GLZ8 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HERC4Q5GLZ8 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERC4Q5GLZ8 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERC4Q5GLZ8 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERC4Q5GLZ8 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HERC4Q5GLZ8 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HERC4Q5GLZ8 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HERC4Q5GLZ8 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HERC4Q5GLZ8 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HERC4Q5GLZ8 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HERC4Q5GLZ8 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HERC4Q5GLZ8 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HERC4Q5GLZ8 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HERC4Q5GLZ8 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HERC4Q5GLZ8 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HERC4Q5GLZ8 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HERC4Q5GLZ8 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HERC4Q5GLZ8 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HERC4Q5GLZ8 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HERC4Q5GLZ8 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HERC4Q5GLZ8 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HERC4Q5GLZ8 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HERC4Q5GLZ8 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HERC4Q5GLZ8 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HERC4Q5GLZ8 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HERC4Q5GLZ8 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HERC4Q5GLZ8 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HERC4Q5GLZ8 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HERC4Q5GLZ8 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HERC4Q5GLZ8 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HERC4Q5GLZ8 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HERC4Q5GLZ8 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HERC4Q5GLZ8 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HERC4Q5GLZ8 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HERC4Q5GLZ8 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HERC4Q5GLZ8 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HERC4Q5GLZ8 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HERC4Q5GLZ8 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HERC4Q5GLZ8 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HERC4Q5GLZ8 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HERC4Q5GLZ8 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HERC4Q5GLZ8 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HERC4Q5GLZ8 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HERC4Q5GLZ8 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HERC4Q5GLZ8 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HERC4Q5GLZ8 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HERC4Q5GLZ8 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HERC4Q5GLZ8 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HERC4Q5GLZ8 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HERC4Q5GLZ8 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HERC4Q5GLZ8 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HERC4Q5GLZ8 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HERC4Q5GLZ8 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HERC4Q5GLZ8 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HERC4Q5GLZ8 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HERC4Q5GLZ8 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HERC4Q5GLZ8 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HERC4Q5GLZ8 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms