Protein–RNA interactions for Protein: Q5GH77

XKR3, XK-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR3Q5GH77 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
XKR3Q5GH77 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XKR3Q5GH77 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms