Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC38Q502W7 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms