Protein–RNA interactions for Protein: Q3YBR2

TBRG1, Transforming growth factor beta regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG1Q3YBR2 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TBRG1Q3YBR2 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TBRG1Q3YBR2 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TBRG1Q3YBR2 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TBRG1Q3YBR2 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TBRG1Q3YBR2 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TBRG1Q3YBR2 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TBRG1Q3YBR2 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TBRG1Q3YBR2 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TBRG1Q3YBR2 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TBRG1Q3YBR2 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TBRG1Q3YBR2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TBRG1Q3YBR2 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TBRG1Q3YBR2 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TBRG1Q3YBR2 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TBRG1Q3YBR2 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TBRG1Q3YBR2 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TBRG1Q3YBR2 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TBRG1Q3YBR2 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TBRG1Q3YBR2 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TBRG1Q3YBR2 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TBRG1Q3YBR2 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TBRG1Q3YBR2 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TBRG1Q3YBR2 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TBRG1Q3YBR2 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TBRG1Q3YBR2 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TBRG1Q3YBR2 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TBRG1Q3YBR2 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TBRG1Q3YBR2 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TBRG1Q3YBR2 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TBRG1Q3YBR2 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TBRG1Q3YBR2 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TBRG1Q3YBR2 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TBRG1Q3YBR2 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TBRG1Q3YBR2 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TBRG1Q3YBR2 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TBRG1Q3YBR2 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TBRG1Q3YBR2 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TBRG1Q3YBR2 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TBRG1Q3YBR2 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TBRG1Q3YBR2 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TBRG1Q3YBR2 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TBRG1Q3YBR2 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TBRG1Q3YBR2 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TBRG1Q3YBR2 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TBRG1Q3YBR2 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TBRG1Q3YBR2 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TBRG1Q3YBR2 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TBRG1Q3YBR2 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TBRG1Q3YBR2 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TBRG1Q3YBR2 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TBRG1Q3YBR2 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TBRG1Q3YBR2 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TBRG1Q3YBR2 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TBRG1Q3YBR2 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TBRG1Q3YBR2 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TBRG1Q3YBR2 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TBRG1Q3YBR2 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TBRG1Q3YBR2 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TBRG1Q3YBR2 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TBRG1Q3YBR2 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TBRG1Q3YBR2 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TBRG1Q3YBR2 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TBRG1Q3YBR2 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TBRG1Q3YBR2 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TBRG1Q3YBR2 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TBRG1Q3YBR2 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TBRG1Q3YBR2 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TBRG1Q3YBR2 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TBRG1Q3YBR2 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TBRG1Q3YBR2 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TBRG1Q3YBR2 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TBRG1Q3YBR2 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TBRG1Q3YBR2 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TBRG1Q3YBR2 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TBRG1Q3YBR2 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TBRG1Q3YBR2 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TBRG1Q3YBR2 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TBRG1Q3YBR2 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TBRG1Q3YBR2 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TBRG1Q3YBR2 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TBRG1Q3YBR2 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TBRG1Q3YBR2 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TBRG1Q3YBR2 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TBRG1Q3YBR2 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TBRG1Q3YBR2 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TBRG1Q3YBR2 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TBRG1Q3YBR2 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TBRG1Q3YBR2 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TBRG1Q3YBR2 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TBRG1Q3YBR2 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TBRG1Q3YBR2 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TBRG1Q3YBR2 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TBRG1Q3YBR2 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TBRG1Q3YBR2 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TBRG1Q3YBR2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TBRG1Q3YBR2 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TBRG1Q3YBR2 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TBRG1Q3YBR2 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TBRG1Q3YBR2 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms