Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI61

KRTAP20-2, Keratin-associated protein 20-2, humanhuman

Predictions only

Length 65 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-2Q3LI61 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP20-2Q3LI61 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms