Protein–RNA interactions for Protein: Q3KP44

ANKRD55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55Q3KP44 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD55Q3KP44 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms