Protein–RNA interactions for Protein: Q32P28

P3H1, Prolyl 3-hydroxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H1Q32P28 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
P3H1Q32P28 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
P3H1Q32P28 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
P3H1Q32P28 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
P3H1Q32P28 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
P3H1Q32P28 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
P3H1Q32P28 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
P3H1Q32P28 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
P3H1Q32P28 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
P3H1Q32P28 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
P3H1Q32P28 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
P3H1Q32P28 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
P3H1Q32P28 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
P3H1Q32P28 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
P3H1Q32P28 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
P3H1Q32P28 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
P3H1Q32P28 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
P3H1Q32P28 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
P3H1Q32P28 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
P3H1Q32P28 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
P3H1Q32P28 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
P3H1Q32P28 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
P3H1Q32P28 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
P3H1Q32P28 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
P3H1Q32P28 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
P3H1Q32P28 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
P3H1Q32P28 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
P3H1Q32P28 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
P3H1Q32P28 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
P3H1Q32P28 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
P3H1Q32P28 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
P3H1Q32P28 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
P3H1Q32P28 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
P3H1Q32P28 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
P3H1Q32P28 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
P3H1Q32P28 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
P3H1Q32P28 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
P3H1Q32P28 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
P3H1Q32P28 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
P3H1Q32P28 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
P3H1Q32P28 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
P3H1Q32P28 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
P3H1Q32P28 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
P3H1Q32P28 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
P3H1Q32P28 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
P3H1Q32P28 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
P3H1Q32P28 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
P3H1Q32P28 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
P3H1Q32P28 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
P3H1Q32P28 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
P3H1Q32P28 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
P3H1Q32P28 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
P3H1Q32P28 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
P3H1Q32P28 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
P3H1Q32P28 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
P3H1Q32P28 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
P3H1Q32P28 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
P3H1Q32P28 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
P3H1Q32P28 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
P3H1Q32P28 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
P3H1Q32P28 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
P3H1Q32P28 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
P3H1Q32P28 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
P3H1Q32P28 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
P3H1Q32P28 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
P3H1Q32P28 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
P3H1Q32P28 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
P3H1Q32P28 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
P3H1Q32P28 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
P3H1Q32P28 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
P3H1Q32P28 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
P3H1Q32P28 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
P3H1Q32P28 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
P3H1Q32P28 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
P3H1Q32P28 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
P3H1Q32P28 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
P3H1Q32P28 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
P3H1Q32P28 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
P3H1Q32P28 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
P3H1Q32P28 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
P3H1Q32P28 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
P3H1Q32P28 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
P3H1Q32P28 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
P3H1Q32P28 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
P3H1Q32P28 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
P3H1Q32P28 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
P3H1Q32P28 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
P3H1Q32P28 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
P3H1Q32P28 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
P3H1Q32P28 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
P3H1Q32P28 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
P3H1Q32P28 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
P3H1Q32P28 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
P3H1Q32P28 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
P3H1Q32P28 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
P3H1Q32P28 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
P3H1Q32P28 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
P3H1Q32P28 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
P3H1Q32P28 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
P3H1Q32P28 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
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