Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC57Q2TAC2 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC57Q2TAC2 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC57Q2TAC2 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC57Q2TAC2 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC57Q2TAC2 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC57Q2TAC2 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC57Q2TAC2 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC57Q2TAC2 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC57Q2TAC2 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC57Q2TAC2 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC57Q2TAC2 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC57Q2TAC2 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC57Q2TAC2 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC57Q2TAC2 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC57Q2TAC2 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC57Q2TAC2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC57Q2TAC2 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC57Q2TAC2 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC57Q2TAC2 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC57Q2TAC2 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC57Q2TAC2 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC57Q2TAC2 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC57Q2TAC2 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC57Q2TAC2 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC57Q2TAC2 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC57Q2TAC2 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC57Q2TAC2 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC57Q2TAC2 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC57Q2TAC2 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC57Q2TAC2 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC57Q2TAC2 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC57Q2TAC2 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC57Q2TAC2 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC57Q2TAC2 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC57Q2TAC2 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC57Q2TAC2 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC57Q2TAC2 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC57Q2TAC2 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC57Q2TAC2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC57Q2TAC2 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC57Q2TAC2 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC57Q2TAC2 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC57Q2TAC2 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC57Q2TAC2 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC57Q2TAC2 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC57Q2TAC2 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC57Q2TAC2 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC57Q2TAC2 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC57Q2TAC2 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC57Q2TAC2 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC57Q2TAC2 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC57Q2TAC2 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC57Q2TAC2 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC57Q2TAC2 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC57Q2TAC2 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC57Q2TAC2 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC57Q2TAC2 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC57Q2TAC2 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC57Q2TAC2 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC57Q2TAC2 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC57Q2TAC2 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC57Q2TAC2 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC57Q2TAC2 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC57Q2TAC2 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC57Q2TAC2 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC57Q2TAC2 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC57Q2TAC2 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC57Q2TAC2 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC57Q2TAC2 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC57Q2TAC2 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC57Q2TAC2 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC57Q2TAC2 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC57Q2TAC2 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC57Q2TAC2 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC57Q2TAC2 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC57Q2TAC2 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC57Q2TAC2 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC57Q2TAC2 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC57Q2TAC2 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC57Q2TAC2 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC57Q2TAC2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC57Q2TAC2 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC57Q2TAC2 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC57Q2TAC2 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC57Q2TAC2 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC57Q2TAC2 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC57Q2TAC2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC57Q2TAC2 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC57Q2TAC2 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC57Q2TAC2 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC57Q2TAC2 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC57Q2TAC2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC57Q2TAC2 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC57Q2TAC2 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC57Q2TAC2 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC57Q2TAC2 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC57Q2TAC2 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC57Q2TAC2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC57Q2TAC2 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms