Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SGSM1Q2NKQ1 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGSM1Q2NKQ1 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms