Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC96Q2M329 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC96Q2M329 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC96Q2M329 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC96Q2M329 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC96Q2M329 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC96Q2M329 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC96Q2M329 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC96Q2M329 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC96Q2M329 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC96Q2M329 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC96Q2M329 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC96Q2M329 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC96Q2M329 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC96Q2M329 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC96Q2M329 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC96Q2M329 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC96Q2M329 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC96Q2M329 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC96Q2M329 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC96Q2M329 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC96Q2M329 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC96Q2M329 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC96Q2M329 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC96Q2M329 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC96Q2M329 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC96Q2M329 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC96Q2M329 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC96Q2M329 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC96Q2M329 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC96Q2M329 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC96Q2M329 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC96Q2M329 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC96Q2M329 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC96Q2M329 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC96Q2M329 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC96Q2M329 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC96Q2M329 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC96Q2M329 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC96Q2M329 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC96Q2M329 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC96Q2M329 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC96Q2M329 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC96Q2M329 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC96Q2M329 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC96Q2M329 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC96Q2M329 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC96Q2M329 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC96Q2M329 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC96Q2M329 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC96Q2M329 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC96Q2M329 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC96Q2M329 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC96Q2M329 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC96Q2M329 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC96Q2M329 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC96Q2M329 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC96Q2M329 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC96Q2M329 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC96Q2M329 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC96Q2M329 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC96Q2M329 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC96Q2M329 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC96Q2M329 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC96Q2M329 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC96Q2M329 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC96Q2M329 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC96Q2M329 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC96Q2M329 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC96Q2M329 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC96Q2M329 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC96Q2M329 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC96Q2M329 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC96Q2M329 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC96Q2M329 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC96Q2M329 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC96Q2M329 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC96Q2M329 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC96Q2M329 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC96Q2M329 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC96Q2M329 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC96Q2M329 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC96Q2M329 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC96Q2M329 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC96Q2M329 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC96Q2M329 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC96Q2M329 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC96Q2M329 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC96Q2M329 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC96Q2M329 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC96Q2M329 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC96Q2M329 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC96Q2M329 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC96Q2M329 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC96Q2M329 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC96Q2M329 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC96Q2M329 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC96Q2M329 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC96Q2M329 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC96Q2M329 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms