Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDO1Q16878 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms