Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLPPQ16740 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
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